مبادرات أبو العينين في إطار الجمعية البرلمانية المتوسطية والجمعية البرلمانية الأورومتوسطية حظيت بتقدير بالغ من أعضائهما، ومن أمثلتها:
– حظي التقرير الذي أعده حول استراتيجية متوسطية لتأمين الطاقة في حوض المتوسط بموافقة إجماعية من أعضاء الجمعية البرلمانية المتوسطية وطالب الأعضاء باختيار أبو العينين مقررًا خاصًا لموضوع الطاقة بالجمعية المتوسطية نظرًا لمعرفته الفريدة في هذا المجال.
– نجح النائب محمد أبو العينين في انتزاع موافقة هيئة مكتب الجمعية البرلمانية الأورومتوسطية على اقتراح د. فتحي سرور رئيس مجلس الشعب على تشكيل لجنة تقصي حقائق برلمانية رفيعة المستوى من الجمعية لتقصي الحقائق حول العدوان الإسرائيلي على غزة وشارك أبو العينين في هذه اللجنة والتي زارت غزة والضفة الغربية وإسرائيل لكن أبو العينين لم يزور إسرائيل.
– وافقت هيئة مكتب الجمعية البرلمانية المتوسطية على اقتراح أبو العينين بتشكيل لجنة برلمانية تجمع بين مهمة تقصي الحقائق حول الوضع في غزة والضفة الغربية ودفع جهود السلام وقامت اللجنة بزيارة الأراضي الفلسطينية المحتلة في مايو 2009.
– بناء على اقتراح أبو العينين خصصت الجمعية البرلمانية الأورومتوسطية جلستها العامة لمناقشة موضوع الأزمة المالية العالمية وتداعياتها على منطقة المتوسط حيث وافق برلماني 41 دولة أعضاء الجمعية على التقرير المتميز الذي أعده أبو العينين حول هذا الموضوع والذي تضمن 41 توصية.
– عقدت الجمعية جلسة عامة استثنائية لها في الأردن في أكتوبر 2008 خصصتها لبحث الإسهام البرلماني في دفع جهود تحقيق السلام في الشرق الأوسط وذلك استجابة لاقتراح النائب محمد أبو العينين والذي رأس وفد مصر في هذه الجلسة.
